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c hdf5 malloc memory memory-management

memory-HDF5可变长度结构，可变长度（C API）

(memory - HDF5 variable length structure, of variable length (C API))

发布于 2015-03-18 20:11:34

我想将STL容器中包含的数据写入HDF5文件。根据我的收集，我需要声明一个连续的内存块，并使用"hdf5.h"C API将数据从内存缓冲区传输到磁盘。

对于常规数据空间，该过程很简单；只需使用即可在堆栈上创建临时数组new。HDF5“了解”这样的内存布局。当处理不规则数据空间时，情况就不同了，因为hvl_t必须使用专用类型。

以下代码段有效，但不是ISO C ++（11）：

// Test data
std::vector< std::vector<int> > jagged_array(3);
jagged_array[0] = {0};
jagged_array[1] = {0, 1, 2, 3};
jagged_array[2] = {0, 1, 2};

hvl_t X[jagged_array.size()];
for (unsigned int i = 0; i < jagged_array.size(); ++i) {
    X[i].len = jagged_array[i].size();
    int * ptr = (int *) malloc (X[i].len * sizeof(int));
    for (unsigned int j = 0; j < X[i].len; ++j) {
        ptr[j] = jagged_array[i][j];
    }
    X[i].p = (void *) ptr;
}

我的C非常生锈。除了非法行之外，此代码段几乎全部从HDF5示例页面中删除hvl_t X[jagged_array.size()];。

我应该如何声明一个hvl_t在运行时确定大小的？它肯定涉及malloc，但是我真的很困惑。

Questioner
jgyou
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community wiki 2015-03-20 23:54:48

@Lashane在评论中回答：

一个人应该简单地使用

hvl_t * X = (hvl_t *)malloc(jagged_array.size() * sizeof(hvl_t))

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